Kuten aiemmissa Prison Tycoon -sarjan peleissä tehtäväsi on pyörittää vankilaa, jossa sinun on huolehdittava, että työntekijäsi ovat tyytyväisiä eivätkä joudu pahoinpidellyiksi, ja lisäksi varmistettava, että vangit pysyvät muurien sisällä. Peli on rakennettu siten, että aloitat pienesti rakentamalla pienen vankilan, jota voit vähitellen laajentaa, jotta tilaa riittää useammille vangeille. Prison Tycoon 3- Lockdownissa johdat yksityistä vankilaa, joka on täynnä kovanaamaisia rikollisia.



